Aan de hoop van Valentino Rossi om voor zijn thuispubliek in Misano te schitteren kwam snel een eind nadat hij in de race al na vijf ronden, op een vierde positie rijdend, uit moest vallen vanwege een probleem aan zijn Yamaha YZR-M1.
Met duizenden enthousiaste Italiaanse fans op de tribunes begon Rossi vanaf de tweede plaats op de grid aan de race waarin hij hoopte de strijd aan te kunnen gaan met zijn belangrijkste rivaal Casey Stoner.
Nadat hij een derde positie bezette na de start werd hij vervolgens gepasseerd door het sterke Rizla Suzuki duo John Hopkins en Chris Vermeulen en kreeg hij vanwege het verlies aan vermogen geen enkele kans terug te slaan waarna hij in de vijfde van de in totaal achtentwintig ronden tellende race zijn machine in de box van het team moest parkeren vanwege een technisch mankement.
Rossi liet na afloop van de race weten niet te zullen opgeven en in de resterende vijf races van het seizoen te zullen vechten voor het resultaat wat ze verdienen;
"Bij de start merkte ik dat mijn banden niet echt op temperatuur waren waardoor ik niet echt goed van de grid kwam. Daarna ging het op zich wel redelijk, wist ik een goed ritme te vinden en had ik het gevoel dat het steeds beter ging aangezien de banden beter op temperatuur kwamen. Helaas ging het in de vijfde ronde mis. Ik remde heel hard, voelde direct dat het niet goed zat en dat de race voor mij over was. De motor waarop ik reed was dezelfde als waarop ik in de trainingen reed en die ik ook tijdens de test in Brno heb gebruikt en hij voelde echt goed aan. Op dit moment weet ik nog niet wat het probleem is maar het team is momenteel druk bezig dit te onderzoeken en we zullen moeten wachten totdat zij de oorzaak hebben kunnen vaststellen. Het was echt balen dat ik al na een paar ronden op moest geven."
"Het zou geweldig en heel nuttig zijn geweest als ik hier in Misano een goed resultaat had kunnen behalen. Ik hou van het circuit en ik wilde heel graag goed presteren voor al mijn fans – het was helemaal geweldig zoveel mensen langs de baan te zien in het geel. Helaas mocht het niet zo zijn en we weten nu dat het kampioenschap heel, heel erg moeilijk gaat worden. We weten dat dit soort dingen kunnen gebeuren en als je dit overkomt dan heb je twee keuzes; opgeven of sterker terug willen komen en nog harder werken dan dat we al deden. Dit laatste is wat Yamaha, ik zelf, mijn team, de engineers en iedereen die betrokken is zullen gaan doen. We hebben nog vijf races te gaan en we zullen gaan vechten voor het resultaat dat we verdienen. We hebben heel veel te doen voor de volgende race in Estoril."