Scot Honda rijder Hiroshi Aoyama was lange tijd de sterkste in de eerste vrije training voor de 250cc klasse maar op het laatst wist Alvaro Bautista de Japanner van de koppositie te verdringen.
Nadat zijn teamgenoot Raffaele de Rosa in het begin even de honneurs waarnam en daarna Ratthapark Wilairot voordat Hiroshi Aoyama het grootste deel van de sessie bovenaan stond. Met nog ruim vijf minuten te gaan was het Alvaro Bautista die de Japanner van de eerste plaats verdreef. Aoyama deed daarna nog ene poging om de Spanjaard weer terug te pakken maar maakte een klein foutje waardoor het net niet lukte en hij een tiende te kort kwam.
Achter de top twee uit Motegi was het de Zwitser Thomas Lüthi die de derde tijd wist te noteren en de enige andere rijder was die onder de 1’44 wist te komen. Mattia Pasini noteerde de vierde tijd voor Gabor Talmacsi, Karel Abraham, Mike di Meglio, Marco Simoncelli, Hector Barbera en Alex Debon.
